bioedit软件下载？怎么利用bioedit做序列的比较

一、怎么利用bioedit做序列的比较

1、网络搜索下载并安装BioEdit软件。

2、将你所要比对的序列以fasta格式粘贴在文本文档里。

3、BioEdit软件打开文本文档，选中所有的序列，按下图方法选择要打开的标签。

4、在新的窗口中，按下图所示勾选Note下面的方框（勾选之后可以在比对的结果中用星星表示，方便你看出哪些地方不一致）和运行“RunClustalW”。

5、然后你就可以看到序列比对的结果了，红色箭头标示的地方就是序列不一致的地方。

二、怎么用bioedit在基因组序列中找出已知序列的序列相似

Bioedit提供了本地blast工具（菜单里的localblast功能），如图一。

你需要把基因组数据做成本地数据库，使用菜单里的createalocalnucleotidedatabasefile功能建立本地DNA数据库，建库的原始数据需要做成fasta格式的，建成的数据库存放在...\bioedit\database文件夹里。

然后用另一种菌的基因序列和基因组本地数据库做blastn或者tblastx（图二），就能找到与这个基因序列相似性较高的contig了。

我的bioedit版本较低，估计也能参考吧。

也可以直接从NCBI下载本地blast相关程序，使用dos命令行操作。